土壤微生物檢測的發(fā)展方向

日前，中國地質(zhì)科學(xué)院水環(huán)所經(jīng)過(guò)積極探索，反復試驗，建立了適合土樣和地下水樣的微生物分子生物學(xué)檢測高新技術(shù)。
土壤微生物檢測技術(shù)通過(guò)對不同樣品微生物DNA的提取，將提取的DNA進(jìn)行擴增并識別，來(lái)確定樣品中微生物的多樣性和種屬，具有性和準確性，免去了煩瑣、需時(shí)長(cháng)的培養過(guò)程，可檢出傳統方法不可培養的微生物，并能原位反映微生物群落結構的真實(shí)情況。微生物分子生物學(xué)技術(shù)的建立，突破了長(cháng)期以來(lái)一直采用的傳統微生物培養技術(shù)方法。該技術(shù)在污染修復、成巖成礦成油機理研究、微生物找礦、污水處理等方面具有廣泛的應用前景，是一種快速準確的高新技術(shù)。
目前，傳統的微生物培養方法只能檢測少量可培養的微生物，不能揭示其余大量的微生物，以至對水土環(huán)境中微生物的多樣性認識以偏概全。近年來(lái)，通過(guò)直接對樣品的DNA分析揭示其微生物種類(lèi)的技術(shù)得到了較大發(fā)展，該技術(shù)可不通過(guò)對微生物進(jìn)行培養的方法，更快速、準確地反映微生物種群的多樣性，為研究水土環(huán)境中的微生物組成開(kāi)辟了一條嶄新的道路。通過(guò)對水土樣品DNA提取純化，利用聚合酶鏈式反應（PCR）技術(shù)，對樣品DNA進(jìn)行擴增，對擴增后的產(chǎn)物再利用變性梯度凝膠電泳（DGGE）技術(shù)，將不同微生物類(lèi)型的DNA基因片段分離，直觀(guān)顯示樣品中微生物群落的多樣性。還可將DGGE技術(shù)的產(chǎn)物再擴增，然后測序，準確鑒定微生物種屬。從樣品DNA提取純化，到PCR擴增，再到DGGE分離和測序，構成了一整套水土環(huán)境中微生物組成多樣性和種屬鑒定研究的分子生物學(xué)檢測技術(shù)。
土壤微生物檢測技術(shù)的建立，突破了長(cháng)期以來(lái)一直采用的傳統微生物培養技術(shù)方法，可以更加直觀(guān)全面地將樣品的多樣性展示出來(lái)，以及準確鑒定微生物種屬。它不僅可以應用于科學(xué)研究，在具體的實(shí)踐工作中也具有很好的應用前景：可顯示在污染環(huán)境修復過(guò)程中，是哪類(lèi)微生物大量繁殖并修復污染，這類(lèi)微生物就可人工添加至類(lèi)似污染環(huán)境，加速污染修復過(guò)程。同時(shí)，在成巖成礦成油的過(guò)程中，通過(guò)微生物參與技術(shù)，可以找到并鑒定相關(guān)的微生物種類(lèi)，為成巖成礦成油機理研究以及利用微生物找礦而建立一種快速有效的手段。
土壤微生物檢發(fā)展方向是快速，準確，簡(jiǎn)便，自動(dòng)化，當前很多生物制品公司利用傳統微生物檢測原理，結合不同的檢測方法，設計了形式各異的微生物檢測儀器設備，正逐步廣泛應用于醫學(xué)微生物檢測和科學(xué)研究領(lǐng)域。例如：
1、土壤微生物檢測抗干擾培養基和微生物數量快速檢測技術(shù)結合解決了傳統微生物檢測手段不能解決的難題，為建立一套完整的抗干擾微生物檢測系統奠定了堅實(shí)的基礎。
2、BACTOMETER 全自動(dòng)各類(lèi)總菌數及快速細菌檢測系統可以數小時(shí)內獲得監測結果，樣本顏色及光學(xué)特征都不影響讀數，對酵母和霉菌檢測同樣高度敏感原理是利用電阻抗法將待測樣本與培養基置于反應試劑盒內，底部有一對不銹鋼電極，測定因微生物生長(cháng)而產(chǎn)生阻抗改變。如微生物生長(cháng)時(shí)可將培養基中的大分子營(yíng)養物經(jīng)代謝轉變?yōu)榛钴S小分子，電阻抗法可測試這種微弱變化，從而比傳統平板法更快速監測微生物的存在及數量。測定項目包括總生菌數，酵母菌，大腸桿菌群，霉菌，乳酸菌，嗜熱菌，革蘭氏陰性菌，金黃色葡萄球菌等。